保密专利申请的审批程序主要依据申请内容是否涉及国防利益而有所不同。以下是具体的审批流程：
一、内容涉及国防利益的保密专利申请
1. 申请提交：申请人向国防专利局提交保密专利申请。
2. 审查与决定：国防专利局对申请进行审查，并给出审查意见。若决定授予国防专利权，将颁发国防专利证书。
3. 公告：国防专利局在专利公报上公告授予的国防专利，包括专利号、申请日和授权公告日。
二、内容涉及国防利益以外的保密专利申请
1. 申请提交与初步审查：
* 申请人向国家知识产权局专利局提交保密专利申请。
* 专利局指定的审查员对申请进行初步审查，审查标准与一般发明专利申请相同。
* 初步审查合格的保密专利申请不予公布。
2. 实质审查：
* 若有实质审查请求并缴纳了实质审查费，申请将直接进入实质审查程序。
* 实质审查同样按照一般发明专利申请的基准进行。
3. 决定与通知：
* 经实质审查没有发现驳回理由的，专利局将作出授予保密专利权的决定。
* 专利局发出授予保密专利的通知书和办理登记手续的通知。
4. 登记与公告：
* 申请人办理专利权登记手续。
* 保密专利申请的授权公告仅公布专利分类号、专利号、专利申请日和授权公告日。
注意事项
1. 申请人在提出保密请求时，需要提交有关部门确定密级的相关文件（如已确定其内容涉及国家安全或者重大利益需要保密）。
2. 对于已确定为保密专利申请的电子申请，如果涉及国家安全或者重大利益需要保密，审查员会将其转为纸件形式继续审查，并通知申请人。此后，申请人应当以纸件形式向专利局或国防专利局递交各种文件。
综上所述，保密专利申请的审批程序根据申请内容是否涉及国防利益而有所不同，但都包括申请提交、审查、决定、通知、登记与公告等关键步骤。在申请过程中，申请人需要密切关注专利局的审查进展，并按照要求提交相关文件和资料。
