商标使用权增值税税率为6%。这一规定主要依据的是《中华人民共和国增值税暂行条例》第二条，特别是其中的第三项。该条例明确规定，纳税人销售服务、无形资产，除本条第一项、第二项、第五项另有规定外，税率为6%。由于商标使用权属于无形资产的一种，因此其增值税率适用这一规定。
此外，《财政部、国家税务总局关于在全国开展交通运输业和部分现代服务业营业税改征增值税试点税收政策的通知》中也明确了商标和著作权转让服务属于文化创意服务的范畴，应缴纳增值税，这也进一步印证了商标使用费应缴纳增值税，并适用6%的税率。
在商标使用权转让过程中，转让方应依法申报并缴纳相应的增值税。同时，受让方也需要注意，如果转让方为个人，且因转让商标使用权获得了收入，那么转让方还需要缴纳个人所得税。而对于受让方来说，在中国签订商标转让合同，也需要根据《印花税暂行条例》的规定缴纳印花税。
总的来说，商标使用权增值税税率为6%，但在实际转让过程中，还需要考虑其他相关税种和规定。因此，在进行商标使用权转让时，建议双方咨询专业税务人员或律师，以确保合法合规地完成交易并缴纳相应税款。
