如果商标转让证明丢失了，可以采取以下措施来补办：
一、及时申请补发
1. 向商标局提出申请：当事人应及时向商标局提交补发商标转让证明的申请。
2. 准备必要的申请材料：包括补发证明申请书、申请人的身份证明（如营业执照、身份证复印件等）、转让协议等材料。申请书中填写的申请人名义、地址应与现商标注册人一致，商标注册号、类别应与原商标注册证明一致。
二、办理途径
1. 委托商标代理机构办理：可以选择任何一家国家认可的商标代理机构来办理补发手续。代理机构会协助准备相关材料，并代表申请人向商标局提交申请。
2. 直接到商标局的商标注册大厅办理：申请人可以自行前往商标局的商标注册大厅，按照规定的步骤提交申请书件、缴纳申请规费。
三、注意事项
1. 补发证明与变更、转让同时办理的情况：
* 如果补发证明与变更商标注册人名义同时办理，补发证明申请应以变更前的商标注册人名义提出。
* 如果补发证明与转让注册商标同时办理，补发证明申请应以转让人名义提出。
2. 查询补发进度：
* 如果直接到商标注册大厅办理，申请人在提出补发证明申请6个月后还未收到补发的注册证明，可向商标局免费查询。
* 如果委托商标代理机构办理，由该商标代理机构负责向商标局查询。
3. 电子版本与纸质版本：
* 目前商标局补办的商标转让证明多为电子版本。如果是委托代理机构办理的业务，可以自己登录系统下载新的电子版本（但下载次数有限制）。
* 如果原商标转让业务办理时使用的是纸质资料或下发的转让证明是纸质的，那么后期的补证也都是纸质的，没有可供下载的电子版本。
四、法律依据
《中华人民共和国商标法》第四十二条：转让注册商标的，转让人和受让人应当签订转让协议，并共同向商标局提出申请。受让人应当保证使用该注册商标的商品质量。转让注册商标的，商标注册人对其在同一种商品上注册的近似的商标，或者在类似商品上注册的相同或者近似的商标，应当一并转让。对容易导致混淆或者有其他不良影响的转让，商标局不予核准，书面通知申请人并说明理由。转让注册商标经核准后，予以公告。受让人自公告之日起享有商标专用权。
《中华人民共和国商标法实施条例》的相关规定：也提供了关于商标转让和补发证明的具体指导和规定。
综上所述，商标转让证明丢失后，当事人应及时向商标局申请补发，并按照规定的步骤和注意事项办理相关手续。
