保密专利审批程序主要依据专利内容是否涉及国防利益而有所不同。以下是具体的审批流程：
一、内容涉及国防利益的保密专利审批程序
1. 申请：申请人向国防专利局提交专利申请。
2. 审查：国防专利局对申请进行审查，并给予审查意见。
3. 决定与公告：国防专利局根据审查结果，作出授予国防专利权的决定。随后，颁发国防专利证书，并在专利公报上公告。
二、内容涉及国防利益以外的保密专利审批程序
1. 申请：申请人向国家知识产权局专利局提交专利申请。
2. 初步审查：专利局指定的审查员对申请进行初步审查。初步审查按照与一般发明专利申请相同的基准进行，初步审查合格的保密专利申请不予公布。
3. 实质审查：对于已有实质审查请求并缴纳实质审查费的申请，直接进入实质审查程序。实质审查也是按照与一般发明专利申请相同的基准进行。
4. 决定与通知：经实质审查，若没有发现驳回理由，专利局将作出授予保密专利权的决定，并发出授予保密专利的通知书和办理登记手续通知书。
5. 登记与公告：申请人办理登记手续后，保密专利获得授权。授权公告仅公布专利分类号、专利号、专利申请日和授权公告日。
注意事项
在专利申请公布或公告前，国务院专利行政部门的工作人员及有关人员对其内容负有保密责任。
对于明显不需要保密的专利申请，审查员应当向申请人发出不予保密通知书。申请人陈述意见后，保密审查员仍认为不需要予以保密处理的，应当发出不予保密决定书，并通知申请人该申请按照一般专利申请处理。
综上所述，保密专利的审批程序根据专利内容是否涉及国防利益而有所不同，但都包括申请、审查、决定与通知、登记与公告等关键步骤。在整个审批过程中，相关人员和机构都负有严格的保密责任。
