针对计算机软件著作权共同侵权问题，可以采取以下措施：
1. 收集证据：著作权侵权通常涉及复杂的法律问题，因此首先要做的是收集所有可能的证据，包括侵权的软件复制件、源代码、目标代码以及相关文档等。此外，还需要收集证据来证明侵权行为的存在以及侵权造成的损失。
2. 协商解决：在发现侵权后，首先尝试与侵权方进行接触和协商，寻求和平解决的方式。如果双方能够达成协议，那么问题可能会更容易解决。
3. 寻求法律帮助：如果协商无果，那么可能需要寻求法律帮助。咨询专业律师，了解具体的法律程序和自身权益。
4. 提起诉讼：在证据充分、协商无果的情况下，可以选择向当地法院提起诉讼，要求侵权者停止侵权行为并赔偿损失。共同侵权的情况下，所有涉及的公司或个人都可能会被列为被告。
5. 加强预防：为了避免未来的侵权事件，应加强对公司内部的培训和管理，确保员工了解版权法律法规，并知道如何避免侵权。此外，还可以考虑在合同中增加有关版权保护的条款。
请注意，以上只是一些基本建议，并不能替代专业的法律咨询。面对具体的法律问题，还是建议寻求专业律师的帮助。
